W Zakładzie Magnetyzmu działają trzy zespoły badawcze:

• Zespół Paleomagnetyzmu
• Zespół Geoelektromagnetyzmu
• Zespół Obserwacji Geomagnetycznych

Zakład współpracuje z dwoma instytutowymi obserwatoriami magnetycznymi

• Centralnym Obserwatorium Geofizycznym w Belsku
• Obserwatorium Geofizycznym na Helu