W Zakładzie Magnetyzmu działają trzy grupy badawcze:

• Paleomagnetyzm i badania środowiskowe (z Laboratorium Paleomagnetyzmu i Badań Środowiskowych)
• Geoelektromagnetyzm
• Obserwacje Geomagnetyczne

Zakład współpracuje z dwoma instytutowymi obserwatoriami magnetycznymi

• Centralnym Obserwatorium Geofizycznym w Belsku
• Obserwatorium Geofizycznym na Helu